Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms