Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms