Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP43Q70EL4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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