Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms