Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms