Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLX4IPQ5VYV7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms