Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms