Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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