Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HES3Q5TGS1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms