Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms