Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms