Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms