Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms