Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms