Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms