Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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