Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT16Q17RD7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms