Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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