Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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