Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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