Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF2Q15853 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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