Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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