Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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