Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDGFRLQ15198 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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