Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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