Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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