Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTTNQ14247 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms