Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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