Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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DDX39BQ13838 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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