Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP1Q13835 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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