Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD1Q13562 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms