Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.764e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.574e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CHTOP-206ENST00000495554 2553 ntTSL 216.3■□□□□ 0.24e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 LMNA-216ENST00000496738 2405 ntTSL 219.08■□□□□ 0.641e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RBM17-212ENST00000496762 1585 ntTSL 27.9□□□□□ -1.141e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RBM17-207ENST00000465906 914 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RBM17-208ENST00000467080 837 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RBM17-210ENST00000476706 927 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FXYD5-213ENST00000592290 883 ntTSL 38.78□□□□□ -17e-17■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.194e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.223e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 EEF1A1-207ENST00000490569 1802 ntTSL 59.2□□□□□ -0.941e-323■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 EEF1A1-206ENST00000488500 792 ntTSL 28.23□□□□□ -1.091e-323■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 EEF1A1-209ENST00000495333 958 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-323■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.52e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 LOXL1-203ENST00000566011 2786 ntTSL 521.07■□□□□ 0.962e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.942e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.932e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 POLR2K-202ENST00000519765 1021 ntTSL 59.77□□□□□ -0.851e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.613e-29■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 510.74□□□□□ -0.693e-29■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.381e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.846e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PPIH-206ENST00000461351 527 ntTSL 37.89□□□□□ -1.156e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 320.88■□□□□ 0.932e-17■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 522.13■■□□□ 1.133e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.199e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 514.63□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.099e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FLOT2-203ENST00000465427 746 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 213.72□□□□□ -0.219e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PIGS-206ENST00000487231 3088 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.349e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PIGS-207ENST00000492429 2658 ntTSL 211.72□□□□□ -0.539e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 EIF3G-206ENST00000588709 828 ntTSL 516.08■□□□□ 0.168e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 515.77■□□□□ 0.128e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.164e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.373e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.353e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.053e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 STX10-208ENST00000591197 907 ntTSL 326.92■■□□□ 1.95e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.831e-25■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.693e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 STX10-206ENST00000588848 1164 ntTSL 224.47■■□□□ 1.515e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.443e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.431e-25■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.413e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 STX10-203ENST00000440593 940 ntTSL 523.56■■□□□ 1.365e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.253e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.23e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.173e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)22.19■■□□□ 1.143e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SSBP4-207ENST00000600244 622 ntTSL 222.17■■□□□ 1.143e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.133e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.093e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.083e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SSBP4-212ENST00000601919 492 ntTSL 521.41■■□□□ 1.023e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 13e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 320.72■□□□□ 0.913e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 319.46■□□□□ 0.713e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.653e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.653e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SERHL2-208ENST00000477564 2096 ntTSL 218.51■□□□□ 0.553e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.533e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DMAC2-212ENST00000594660 582 ntTSL 317.89■□□□□ 0.453e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-216ENST00000480865 1540 ntTSL 517.81■□□□□ 0.443e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TMEM8A-205ENST00000448854 858 ntTSL 216.76■□□□□ 0.273e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FBXO6-202ENST00000449067 928 ntTSL 316.68■□□□□ 0.263e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TMEM8A-202ENST00000424078 844 ntTSL 316.44■□□□□ 0.223e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PSMC5-219ENST00000584880 597 ntTSL 315.41■□□□□ 0.063e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SERHL2-209ENST00000527167 1712 ntTSL 515.23■□□□□ 0.033e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 FAH-211ENST00000561353 324 ntTSL 515.14■□□□□ 0.012e-13■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-211ENST00000452171 927 ntTSL 314.86□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DMAC2-207ENST00000589503 2317 ntTSL 214.76□□□□□ -0.053e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.053e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.083e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TMEM8A-206ENST00000467452 646 ntTSL 214.25□□□□□ -0.133e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-214ENST00000469559 4720 ntTSL 213.31□□□□□ -0.283e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC12.42□□□□□ -0.423e-7■■□□□ 12.7
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 289.3 ms