Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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