Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RLFQ13129 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLFQ13129 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms