Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CHAF1AQ13111 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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