Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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