Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALNT1Q10472 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms