Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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