Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms