Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLFN5Q08AF3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms