Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms