Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PUDPQ08623 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms