Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms