Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 POLR2H-202ENST00000429568 878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PTPN20-222ENST00000509774 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 IZUMO3-202ENST00000543880 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC00958-201ENST00000504230 1558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PADI4-202ENST00000375453 841 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL352977.1-201ENST00000553464 453 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AL162574.3-201ENST00000623209 612 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AC115619.1-201ENST00000567376 1605 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB1Q02641 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms