Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSG1Q02413 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms