Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHDQ02161 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms