Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms