Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms