Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DEFA6Q01524 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms