Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2BP78356 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms